Історія комуналнього закладу "Спеціальний навчально-виховний комплекс І-ІІ ступенів №2" тісно пов’язана з історією нашої країни, з розвитком освіти та дефектологічної науки.
24 березня 1953 року на базі школи-інтернату для слабочуючих дітей за адресою: м.Харків, вул.Свердлова, б.115 була заснована Харківська допоміжна школа-інтернат №2.
У 1975 році школа-інтернат переїхала до приміщення СШ № 107 за адресою: м.Харків пров.Карпівський 21/23.
Майже шість десятиліть спеціальна школа-інтернат проводить плідну діяльність щодо навчання та виховання учнів з особливими освітніми потребами. Понад 2500 учнів пройшли підготовку в її стінах, отримали путівку в життя.
Корекційна спрямованість навчання та виховання учнів, цілі і задачі роботи з дітьми, що мають особливі освітні потреби, визначили специфіку діяльності адміністрації та педагогічного колективу навчального закладу.
З 2011 року навчальний заклад перейменовано на комунальний заклад "Спеціальний навчально-виховний комплекс І-ІІ ступенів № 2" Харківської обласної ради.
Очолювали навчальний заклад протягом цих років директори:
1. Тимошенко Д.М. (1953-1957)
2. Яковенко Н.З. (1957-1963)
3. Савіна В.У. (1963-1967)
4. Хоперська Л.Н. (1967-1975)
5. Олійник Н.Ф. (1975-1994)
6. Антоненко В.І. (1994-1999)
7. Фурсова Л.В. (1999-2010)
8. Мельнікова Л.О. з 2011 року